В селе Ахпат церковь существовала еще с IV в. и полагают, что на месте монастыря также существовала церковь. Во время раскопок здесь было обнаружено множество предметов Бронзовой эпохи, а протекающая рядом река Дебет сохранила следы человеческой деятельности времен Палеолита. Хотя история основания монастыря Ахпат восходит ко времени правления царя Аббаса Багратуни (929-953), строительство самой старой церкви монастыря началось в 976 г. в период царствования Ашота III Вогормаца (всемилостивого), 953-977. По заказу царицы Хосровануйш в честь ее сыновей Смбата и Кюрике началось строительство церкви Св.Ншан, которое завершилось в 991 г. После падения в Ани царства Багратуни в 1064 г. монастырь переживает упадок, но вновь возраждается под покровительством Кюрикянов и, особенно, Закарянов, которым монастырь был дан в дар за военную помощь, предоставленную Орбелянам в Грузии, и за то,что они в конце XII века освободили северо-восточную Армению от сельджуков. В середине XIII
